2026.08.31

外泌體如何被萃取?5大胞外囊泡分離與純化技術解析

外泌體如何被萃取?解析外泌體純化技術
本示意圖由人工智慧AI技術輔助生成

外泌體如何被萃取?5大胞外囊泡分離與純化技術解析

外泌體與胞外囊泡存在於複雜的生物液體中,真正的技術關鍵不只是 「把囊泡分離出來」, 更要兼顧 純度、完整性、回收率、批次穩定性與量產能力。 本文一次解析超高速離心、超濾、TFF、SEC與PEG等5大常見純化技術。


快速看懂:外泌體是怎麼被萃取出來的?

外泌體或胞外囊泡的製備,通常不是單一步驟完成,而是經過:

原料取得 → 前處理 → 濃縮 → 分離純化 → 品質鑑定

  • 研究常用:超高速離心 UC
  • 快速濃縮:超濾 UF
  • 大量製備:切向流過濾 TFF
  • 溫和純化:尺寸排阻層析 SEC
  • 初步富集:PEG沉澱

文章目錄

  1. 外泌體與胞外囊泡有什麼不同?
  2. 外泌體是怎麼被萃取出來的?
  3. 5大胞外囊泡分離純化技術
  4. 不同外泌體萃取方法比較
  5. 外泌體品質如何確認?
  6. 外泌體原料開發趨勢
  7. 拜寧騰能特殊來源胞外囊泡
  8. EXOGUARD™製備技術平台
  9. 結論
  10. 常見問題 FAQ

外泌體(Exosome)與胞外囊泡(Extracellular Vesicles, EVs)近年成為 再生醫學、生物科技及高機能保養品 的重要研究方向。

這些奈米級囊泡由細胞釋放,具有脂質雙層膜結構, 內部可攜帶蛋白質、脂質、核酸及其他生物活性分子, 因此被廣泛研究作為 細胞間訊息傳遞載體、生物標誌物及活性成分載體

然而,胞外囊泡存在於細胞培養液、乳汁、植物組織液、微生物發酵液等複雜環境中, 周圍同時存在大量蛋白質、脂質、核酸及其他奈米粒子。

外泌體開發真正的技術關鍵: 如何從複雜原料中分離、濃縮與純化胞外囊泡, 同時維持囊泡結構完整性、降低雜質, 並建立可重複、可放大的製程。

先搞懂:外泌體與胞外囊泡有什麼不同?

「外泌體」是目前市場上非常常見的名稱,但從科學研究角度來看, 外泌體其實是胞外囊泡的一種類型

胞外囊泡(EVs)泛指由細胞釋放、具有脂質雙層膜且本身無法自行複製的顆粒。

依照國際胞外囊泡學會(ISEV)發布的 MISEV2023 指南,若沒有進一步證明囊泡確實來自細胞內的 endosomal system(內體系統), 研究上建議優先使用較中性的「胞外囊泡(EVs)」名稱, 而不是單純依照顆粒大小就稱為外泌體。

本文用詞說明: 本文會保留市場較熟悉的「外泌體」作為搜尋與說明用語; 涉及製程、鑑定與研究規範時,則以 「胞外囊泡(EVs)」 作為較精確的名稱。


外泌體是怎麼被萃取出來的?

一般胞外囊泡製備流程,大致可分成5個階段:

01|取得來源原料
例如細胞培養液、乳汁、植物組織或微生物發酵液。
02|前處理
去除細胞、菌體、組織碎片與大型顆粒。
03|濃縮
縮小樣品體積,提高胞外囊泡濃度。
04|分離與純化
去除游離蛋白、脂質及其他非囊泡顆粒。
05|品質鑑定
確認粒徑、濃度、形態、相關標誌物與雜質程度。

其中, 「分離與純化」 是最影響產率、純度及後續應用的重要步驟。


5大外泌體/胞外囊泡分離與純化技術

1. 超高速離心法(Ultracentrifugation, UC)

超高速離心是胞外囊泡研究中歷史悠久、使用相當廣泛的方法。

其原理是利用不同顆粒的 大小、密度與沉降速度差異, 透過多階段離心逐步去除細胞、細胞碎片及大型囊泡, 最後再以高速離心收集較小型胞外囊泡。

優點
  • 技術成熟,研究文獻豐富
  • 不需額外加入沉澱試劑
  • 適合實驗室研究
  • 可進一步濃縮胞外囊泡
限制
  • 需要超高速離心設備
  • 操作時間較長
  • 可能造成囊泡聚集或結構影響
  • 蛋白質與其他顆粒可能共同沉降
  • 大量製程放大較不方便

2. 超濾法(Ultrafiltration, UF)

超濾利用半透膜及不同截留條件, 依據顆粒大小與膜特性進行濃縮與初步分離。

實務上常搭配不同的 分子量截留值(Molecular Weight Cut-Off, MWCO), 讓較小分子通過膜,而較大型奈米囊泡留在濃縮液中。

優點
  • 操作速度較快
  • 不需超高速離心設備
  • 適合樣品濃縮
  • 製程相對容易建立
限制
  • 囊泡可能吸附於膜材
  • 複雜樣品可能造成膜堵塞
  • 其他奈米顆粒可能共同截留
  • 單獨使用時純度有限

3. 切向流過濾(Tangential Flow Filtration, TFF)

切向流過濾是近年胞外囊泡商業化製程中特別受到關注的技術。

與一般液體直接垂直壓向濾膜的「死端過濾」不同, TFF讓液體 平行於濾膜表面流動, 可減少顆粒持續堆積在膜面上的問題。

透過適當的膜孔徑、流速、壓力及循環條件, 可進行大量樣品的濃縮與緩衝液置換。

優點
  • 適合處理較大體積樣品
  • 容易進行製程放大
  • 可濃縮及進行緩衝液置換
  • 有利於維持囊泡完整性
  • 適合原料量產與商業化開發
限制
  • 設備及耗材成本較高
  • 可能發生膜污染或阻塞
  • 製程參數需依樣品最佳化
  • 相近尺寸雜質可能共同保留
  • 條件不當仍可能造成囊泡損失或聚集

4. 尺寸排阻層析(Size Exclusion Chromatography, SEC)

尺寸排阻層析利用不同顆粒的 流體動力學尺寸(Hydrodynamic Size) 進行分離。

SEC層析柱內含多孔性填料。 較大的胞外囊泡無法進入較小孔洞,因此會較早流出; 較小的游離蛋白與分子則進入填料孔洞,在柱內移動較久,因此較晚流出。

優點
  • 分離條件相對溫和
  • 有利於維持囊泡結構與活性
  • 可降低許多游離蛋白污染
  • 適合作為高品質純化步驟
限制
  • 單次處理體積受層析柱限制
  • 收集後樣品可能被稀釋
  • 大量原料通常需先濃縮
  • 相近尺寸顆粒仍可能共同流出

5. 聚乙二醇沉澱法(PEG Precipitation)

聚乙二醇(Polyethylene Glycol, PEG)可改變溶液環境, 使胞外囊泡及其他大分子顆粒降低溶解度而形成沉澱, 再透過離心收集。

優點
  • 操作方式簡單
  • 不需要昂貴設備
  • 成本相對較低
  • 適合初步富集
限制
  • 純度通常較低
  • 蛋白質及其他顆粒容易共同沉澱
  • PEG殘留可能影響後續分析
  • 較適合「富集」,不宜直接等同高純度純化

不同外泌體/胞外囊泡萃取方法比較

方法主要原理優勢主要限制較適合用途
超高速離心 UC沉降速度與密度差異技術成熟、研究資料多設備需求高、可能共同沉降雜質實驗研究
超濾 UF膜截留與尺寸差異快速、容易濃縮膜吸附、堵塞、純度有限樣品濃縮
切向流過濾 TFF液體平行膜面過濾可放大、適合大量製備設備成本、製程需最佳化原料開發、量產
尺寸排阻層析 SEC流體動力學尺寸差異溫和、可降低游離蛋白樣品容量與濃度受限高品質純化
PEG沉澱改變溶解度使顆粒沉澱簡單、成本低雜質共同沉澱、純度較低初步富集

哪一種外泌體萃取方法最好?

沒有單一方法適合所有胞外囊泡。 製程需要同時考量原料來源、樣品體積、所需純度、回收率、 囊泡完整性、下游用途、成本與是否需要大量生產。 因此,現代胞外囊泡製程越來越常採用 複合式純化策略


外泌體品質確認:取得奈米粒子還不夠

能測到100 nm左右的奈米粒子, 並不能直接證明這些顆粒就是高純度外泌體

目前胞外囊泡研究強調使用多種互補分析方式, 從粒徑、數量、形態、蛋白質組成與雜質等不同面向確認樣品品質。

1. 粒徑與粒子濃度分析

奈米粒子追蹤分析(Nanoparticle Tracking Analysis, NTA) 可分析樣品中的粒徑分布與粒子濃度, 是胞外囊泡研究中常見的物理性分析工具。

但NTA主要是「看到奈米顆粒」, 並不能單獨證明每一顆粒子都是胞外囊泡。

2. 囊泡形態分析

常見方法包括:

  • TEM(Transmission Electron Microscopy,穿透式電子顯微鏡)
  • Cryo-EM
  • AFM(Atomic Force Microscopy,原子力顯微鏡)

這類方法可協助觀察奈米級囊泡的形態與膜結構。

3. 蛋白質標誌分析

對於哺乳動物細胞來源EV,可依研究目的分析:

  • CD9
  • CD63
  • CD81
  • TSG101
  • ALIX

但不同生物來源的胞外囊泡並不一定具有相同標誌, 因此植物、乳源與微生物來源胞外囊泡, 需要建立符合各自來源的品質判定方式。

4. 同時確認「有哪些雜質」

高品質EV製程不只是證明「有胞外囊泡」,還需要確認是否存在:

  • 游離蛋白
  • 脂蛋白
  • 細胞碎片
  • 非囊泡型奈米顆粒
  • 游離核酸
  • 培養基或原料殘留物

真正重要的品質概念: 不只確認「有多少顆粒」, 還要知道 「這些顆粒是什麼,以及混入多少非囊泡成分」


未來外泌體原料開發趨勢:從「分離得到」走向「製程標準化」

1. 大量製備能力

實驗室處理幾毫升樣品, 與商業生產處理數十公升甚至更大規模原料, 是完全不同的製程挑戰。

因此是否具備 Scale-up製程放大能力 非常重要。

2. 批次一致性

同一種胞外囊泡原料,每批的:

  • 粒徑分布
  • 粒子濃度
  • 原料組成
  • 活性表現
  • 雜質含量

都需要建立規格與品質控制。

3. 囊泡結構與活性保存

從萃取、過濾、純化、濃縮、保存到最終配方, 每一個製程條件都可能影響胞外囊泡。

如何降低製程造成的結構破壞、聚集與活性流失, 是量產的重要課題。

4. 複合式純化製程

目前不少研究與產業製程會將不同技術組合,例如:

TFF濃縮 → SEC純化

利用TFF處理較大體積樣品,再利用SEC降低部分游離蛋白及小分子雜質, 可兼顧製程放大與純度需求。

因此,真正重要的不是「哪一台設備最好」, 而是能否依原料特性建立 適合該來源的完整純化流程


拜寧騰能生技開發多元特殊來源胞外囊泡

拜寧騰能生技持續投入 特殊來源胞外囊泡 的研究與原料化開發, 從不同生物來源探索具有應用潛力的囊泡系統。

目前研發方向包括:

  • 乳源外泌體/胞外囊泡
  • 益生菌胞外囊泡
  • 植物來源胞外囊泡

不同來源具有不同的原料組成、背景雜質與製程難點, 因此不能全部套用完全相同的純化流程。

不同來源胞外囊泡的製程差異

項目植物胞外囊泡乳源外泌體/胞外囊泡益生菌胞外囊泡
原料來源植物組織、培養液牛乳、羊乳等乳汁微生物發酵液
主要干擾物多醣、色素、植物蛋白及組織碎片酪蛋白、乳脂球與乳蛋白菌體、培養基與發酵代謝物
前處理重點去除植物組織及大型碎片去脂、降低酪蛋白干擾去除完整菌體
製程放大難度中~高相對容易控制
批次控制重點植物來源、季節及培養條件乳源、組成及來源差異發酵菌株與培養條件
差異化特色植物來源活性分子天然乳源營養與脂質環境微生物發酵與微生態技術

EXOGUARD™:拜寧胞外囊泡製備技術平台

針對不同來源胞外囊泡的純化需求, 拜寧騰能生技建立 EXOGUARD™ 胞外囊泡製備系統

EXOGUARD™ 製程設計重點

  • 不依賴超高速離心作為主要製備方式
  • 依不同原料進行前處理與分段純化
  • 採用分段式低速離心與溫和提取概念
  • 搭配保護劑與穩定策略,降低囊泡結構受損與聚集風險
  • 依植物、乳源及微生物來源建立不同前處理條件
  • 結合專利製程設備與原料化技術
  • 強化後續量產與批次品質控制的可能性

不同來源的胞外囊泡,本來就存在不同的製程難題。

例如植物來源需要處理多醣、色素與植物組織; 乳源樣品需要面對大量酪蛋白及乳脂; 益生菌發酵液則需要將完整菌體與胞外囊泡有效區隔。

因此,拜寧的研發核心不是單純使用某一種外泌體萃取設備, 而是依照 原料來源 × 前處理 × 純化 × 穩定化 × 品質分析 建立完整的胞外囊泡原料開發流程。


結論:外泌體真正的技術門檻,不只是「萃取」

外泌體與胞外囊泡的研究,已逐漸從基礎科學走向實際產品與原料開發。

植物來源胞外囊泡、乳源胞外囊泡及益生菌胞外囊泡, 由於來源與攜帶成分不同, 各自具有不同的研究價值與應用潛力, 也讓胞外囊泡成為生物科技與高機能美容原料的重要發展方向。

但真正決定胞外囊泡原料品質的, 不只是「有沒有把奈米顆粒萃取出來」。

完整胞外囊泡原料開發流程:

來源篩選 → 前處理 → 濃縮 → 分離純化 → 品質鑑定 → 安全性評估 → 功能驗證 → 穩定化 → 商品化

唯有透過科學化製程控制與分析數據, 才能將胞外囊泡從實驗室研究材料, 進一步轉化為具品質規格與市場競爭力的新世代生技原料。

未來,隨著生物製程、分析技術及相關規範逐漸成熟, 胞外囊泡有機會持續結合 天然來源、生物科技與精準保養 概念,為化粧品與生技產業帶來更多創新的原料應用可能。


常見問題 FAQ:外泌體萃取與胞外囊泡純化

Q1:外泌體是怎麼萃取出來的?

外泌體或胞外囊泡通常不是透過單一步驟直接「萃取」, 而是先將細胞、菌體或組織碎片去除, 再經過濃縮、分離與純化。 常見技術包括超高速離心、超濾、TFF、SEC及PEG沉澱等。

Q2:哪一種外泌體純化方法最好?

沒有一種方法適合所有樣品。 超高速離心常見於研究使用; TFF較適合大量樣品濃縮與製程放大; SEC則常用於降低部分游離蛋白污染。 實際製程需依原料來源、樣品量、純度與最終用途選擇。

Q3:為什麼常看到TFF+SEC的組合?

TFF適合處理較大的樣品體積,可先將胞外囊泡濃縮; SEC則能進一步依尺寸差異降低部分游離蛋白與小分子雜質。 兩種技術搭配,可分別發揮「大量濃縮」與「進一步純化」的優勢。

Q4:只用NTA測到100 nm顆粒,就代表是外泌體嗎?

不能。NTA主要分析奈米顆粒尺寸與濃度, 但蛋白聚集物、脂蛋白及其他奈米顆粒也可能落在相似尺寸範圍。 因此還需要搭配電子顯微鏡、相關蛋白標誌及雜質分析等多種方法確認。

Q5:植物、牛奶與益生菌來源胞外囊泡,可以用同一套製程嗎?

通常需要依來源調整。 植物樣品可能含大量多醣、色素與植物蛋白; 乳源樣品具有酪蛋白與乳脂球; 益生菌發酵液則含完整菌體及培養基成分。 因此不同原料需要設計不同的前處理、分離及品質控制條件。


參考文獻

  1. Doyle LM, Wang MZ. Overview of Extracellular Vesicles, Their Origin, Composition, Purpose, and Methods for Exosome Isolation and Analysis. Cells. 2019;8(7):727. DOI
  2. Northrop-Albrecht EJ, Taylor WR, Huang BQ, Kisiel JB, Lucien F. Assessment of extracellular vesicle isolation methods from human stool supernatant. Journal of Extracellular Vesicles. 2022;11(4):e12208. DOI
  3. Welsh JA, Goberdhan DCI, O'Driscoll L, et al. Minimal information for studies of extracellular vesicles (MISEV2023): From basic to advanced approaches. Journal of Extracellular Vesicles. 2024;13(2):e12404. DOI
  4. Stam J, Bartel S, Bischoff R, Wolters JC. Isolation of extracellular vesicles with combined enrichment methods. Journal of Chromatography B. 2021;1169:122604. DOI

拜寧騰能生技|胞外囊泡原料 × 配方開發 × OEM/ODM/IDM

拜寧騰能生技持續投入 乳源胞外囊泡、益生菌胞外囊泡、植物來源胞外囊泡及EXOGUARD™製備技術平台 研發,並提供從特色原料、配方設計、劑型開發、生產製造到包裝成品的一站式服務。

OEM、ODM到IDM, 協助品牌將研發概念進一步轉化為具技術特色與市場差異化的產品。

歡迎來信洽詢: service@bio-nin.com
官方LINE: 加入官方LINE
填寫表單,我們將會與您聯繫。
來電洽詢: 03-9289948 #2201 業務部


返回頁面頂端